Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL3Q8ND23 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CARMIL3Q8ND23 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
CARMIL3Q8ND23 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CARMIL3Q8ND23 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL3Q8ND23 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms