Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C17orf53Q8N3J3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C17orf53Q8N3J3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
C17orf53Q8N3J3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C17orf53Q8N3J3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C17orf53Q8N3J3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms