Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ANKRD35Q8N283 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ANKRD35Q8N283 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ANKRD35Q8N283 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ANKRD35Q8N283 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ANKRD35Q8N283 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms