Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG4Q86SJ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSG4Q86SJ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSG4Q86SJ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms