Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KRT28Q7Z3Y7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KRT28Q7Z3Y7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KRT28Q7Z3Y7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KRT28Q7Z3Y7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
KRT28Q7Z3Y7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.8■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.79■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.77■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
KRT28Q7Z3Y7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms