Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDXQ7Z353 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDXQ7Z353 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDXQ7Z353 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDXQ7Z353 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDXQ7Z353 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDXQ7Z353 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms