Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB11FIP1Q6WKZ4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP1Q6WKZ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP1Q6WKZ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms