Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
METAP1DQ6UB28 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
METAP1DQ6UB28 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
METAP1DQ6UB28 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms