Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y7H0

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1Q5Y7H0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DQA1Q5Y7H0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DQA1Q5Y7H0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DQA1Q5Y7H0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DQA1Q5Y7H0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms