Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC01545Q5VT33 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC01545Q5VT33 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms