Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
FRMPD1Q5SYB0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
FRMPD1Q5SYB0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
FRMPD1Q5SYB0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
FRMPD1Q5SYB0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
FRMPD1Q5SYB0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
FRMPD1Q5SYB0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
FRMPD1Q5SYB0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
FRMPD1Q5SYB0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
FRMPD1Q5SYB0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
FRMPD1Q5SYB0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
FRMPD1Q5SYB0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
FRMPD1Q5SYB0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
FRMPD1Q5SYB0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FRMPD1Q5SYB0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
FRMPD1Q5SYB0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.49■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms