Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SNAPC4Q5SXM2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
SNAPC4Q5SXM2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SNAPC4Q5SXM2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
SNAPC4Q5SXM2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms