Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HSP90AA4PQ58FG1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HSP90AA4PQ58FG1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSP90AA4PQ58FG1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms