Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TDRD12Q587J7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TDRD12Q587J7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TDRD12Q587J7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD12Q587J7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms