Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM259Q4ZIN3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM259Q4ZIN3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM259Q4ZIN3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM259Q4ZIN3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms