Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZM63

ETDB, Embryonic testis differentiation homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETDBQ3ZM63 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETDBQ3ZM63 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
ETDBQ3ZM63 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETDBQ3ZM63 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms