Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT31Q15323 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT31Q15323 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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