Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRD3Q15059 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRD3Q15059 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRD3Q15059 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
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