Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PLS1Q14651 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLS1Q14651 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLS1Q14651 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
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