Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SQLEQ14534 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SQLEQ14534 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SQLEQ14534 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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