Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms