Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN5AQ14524 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN5AQ14524 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN5AQ14524 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN5AQ14524 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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