Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTAN1Q13813 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPTAN1Q13813 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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