Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SHROOM2Q13796 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SHROOM2Q13796 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SHROOM2Q13796 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SHROOM2Q13796 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SHROOM2Q13796 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SHROOM2Q13796 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.05■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC40.04■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC40.04■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
SHROOM2Q13796 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC40■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
SHROOM2Q13796 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC39.94■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SHROOM2Q13796 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
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