Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX1Q13596 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX1Q13596 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX1Q13596 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX1Q13596 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
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