Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EIF4EBP1Q13541 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EIF4EBP1Q13541 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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