Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAPC2Q13487 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAPC2Q13487 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAPC2Q13487 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAPC2Q13487 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAPC2Q13487 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAPC2Q13487 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAPC2Q13487 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAPC2Q13487 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAPC2Q13487 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAPC2Q13487 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAPC2Q13487 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SNAPC2Q13487 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNAPC2Q13487 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNAPC2Q13487 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms