Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD4Q13485 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD4Q13485 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD4Q13485 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD4Q13485 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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