Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMOD3Q0VAK6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMOD3Q0VAK6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
LMOD3Q0VAK6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
LMOD3Q0VAK6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms