Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGR3Q06889 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EGR3Q06889 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EGR3Q06889 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms