Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD51Q06609 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD51Q06609 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms