Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE3AQ05086 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBE3AQ05086 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3AQ05086 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3AQ05086 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms