Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNEQ04844 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNEQ04844 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms