Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NHLH1Q02575 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NHLH1Q02575 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NHLH1Q02575 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NHLH1Q02575 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms