Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF8Q02556 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IRF8Q02556 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms