Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBX4P57082 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX4P57082 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX4P57082 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX4P57082 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX4P57082 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX4P57082 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX4P57082 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBX4P57082 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TBX4P57082 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TBX4P57082 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TBX4P57082 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TBX4P57082 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX4P57082 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX4P57082 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX4P57082 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX4P57082 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TBX4P57082 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX4P57082 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX4P57082 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX4P57082 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX4P57082 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX4P57082 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX4P57082 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBX4P57082 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX4P57082 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX4P57082 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX4P57082 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX4P57082 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX4P57082 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX4P57082 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX4P57082 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX4P57082 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX4P57082 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBX4P57082 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBX4P57082 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBX4P57082 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TBX4P57082 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBX4P57082 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBX4P57082 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TBX4P57082 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBX4P57082 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBX4P57082 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBX4P57082 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX4P57082 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX4P57082 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX4P57082 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX4P57082 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX4P57082 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX4P57082 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX4P57082 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX4P57082 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX4P57082 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX4P57082 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX4P57082 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX4P57082 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX4P57082 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX4P57082 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX4P57082 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX4P57082 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX4P57082 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX4P57082 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX4P57082 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX4P57082 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX4P57082 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX4P57082 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX4P57082 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX4P57082 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX4P57082 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX4P57082 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX4P57082 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX4P57082 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX4P57082 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX4P57082 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX4P57082 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX4P57082 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX4P57082 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBX4P57082 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TBX4P57082 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX4P57082 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX4P57082 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX4P57082 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX4P57082 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX4P57082 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX4P57082 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.4 ms