Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN15P56746 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN15P56746 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN15P56746 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms