Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN5P54829 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN5P54829 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN5P54829 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN5P54829 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms