Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMS1P54277 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMS1P54277 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PMS1P54277 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PMS1P54277 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PMS1P54277 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PMS1P54277 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PMS1P54277 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PMS1P54277 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMS1P54277 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMS1P54277 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMS1P54277 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMS1P54277 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMS1P54277 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMS1P54277 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMS1P54277 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMS1P54277 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMS1P54277 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMS1P54277 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMS1P54277 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMS1P54277 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS1P54277 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PMS1P54277 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PMS1P54277 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PMS1P54277 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PMS1P54277 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PMS1P54277 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PMS1P54277 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PMS1P54277 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PMS1P54277 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PMS1P54277 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
PMS1P54277 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PMS1P54277 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PMS1P54277 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PMS1P54277 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PMS1P54277 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PMS1P54277 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PMS1P54277 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PMS1P54277 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PMS1P54277 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PMS1P54277 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PMS1P54277 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PMS1P54277 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PMS1P54277 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PMS1P54277 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMS1P54277 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMS1P54277 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMS1P54277 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMS1P54277 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PMS1P54277 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PMS1P54277 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PMS1P54277 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PMS1P54277 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PMS1P54277 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PMS1P54277 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PMS1P54277 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PMS1P54277 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PMS1P54277 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PMS1P54277 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PMS1P54277 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PMS1P54277 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PMS1P54277 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PMS1P54277 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PMS1P54277 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PMS1P54277 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PMS1P54277 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS1P54277 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS1P54277 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS1P54277 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS1P54277 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS1P54277 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS1P54277 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS1P54277 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PMS1P54277 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PMS1P54277 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PMS1P54277 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms