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Protein–RNA interactions for Protein: P53238
PEF1, Peflin, yeast
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335 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
PEF1
P53238
TCB1
YOR086C
3561 nt
6.34
□□□□□ -1.39
PEF1
P53238
TPI1
YDR050C
747 nt
6.34
□□□□□ -1.39
PEF1
P53238
RFA2
YNL312W
822 nt
6.34
□□□□□ -1.39
PEF1
P53238
IRC11
YOR013W
471 nt
6.34
□□□□□ -1.39
PEF1
P53238
ALG5
YPL227C
1005 nt
6.34
□□□□□ -1.39
PEF1
P53238
RTC2
YBR147W
891 nt
6.34
□□□□□ -1.39
PEF1
P53238
AFG3
YER017C
2286 nt
6.33
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
RPN5
YDL147W
1338 nt
6.33
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
ISY1
YJR050W
708 nt
6.33
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
MIX17
YMR002W
471 nt
6.33
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
MNN9
YPL050C
1188 nt
6.33
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
ECM2
YBR065C
1095 nt
6.33
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
ALT2
YDR111C
1524 nt
6.33
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
JIP4
YDR475C
2631 nt
6.32
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
GUS1
YGL245W
2127 nt
6.32
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
ATG18
YFR021W
1503 nt
6.32
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
KNS1
YLL019C
2214 nt
6.32
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
ECM38
YLR299W
1983 nt
6.32
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
HGH1
YGR187C
1185 nt
6.32
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
LOT6
YLR011W
576 nt
6.32
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
YML079W
YML079W
606 nt
6.32
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
PAP2
YOL115W
1755 nt
6.31
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
MSS51
YLR203C
1311 nt
6.31
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
HNM1
YGL077C
1692 nt
6.31
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
DST1
YGL043W
930 nt
6.31
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
YHR033W
YHR033W
1272 nt
6.31
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
RPR1
RPR1
369 nt
6.31
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
HAL1
YPR005C
885 nt
6.31
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
FET4
YMR319C
1659 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
YCR006C
YCR006C
474 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
YHP1
YDR451C
1062 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
RAI1
YGL246C
1164 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
VPS65
YLR322W
315 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
MTQ1
YNL063W
945 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
MSO1
YNR049C
633 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
MOD5
YOR274W
1287 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
ELC1
YPL046C
300 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
CTR1
YPR124W
1221 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
SVF1
YDR346C
1446 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
IME2
YJL106W
1938 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
RAP1
YNL216W
2484 nt
6.3
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
VHT1
YGR065C
1782 nt
6.29
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
YCR041W
YCR041W
333 nt
6.29
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
FZF1
YGL254W
900 nt
6.29
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
ERV2
YPR037C
591 nt
6.29
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
BDF2
YDL070W
1917 nt
6.29
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
STE3
YKL178C
1413 nt
6.28
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
DEF1
YKL054C
2217 nt
6.28
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
MMS2
YGL087C
414 nt
6.28
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
NTG1
YAL015C
1200 nt
6.28
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
CCP1
YKR066C
1086 nt
6.28
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
CAR2
YLR438W
1275 nt
6.28
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
YML034C-A
YML034C-A
399 nt
6.28
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
RCK1
YGL158W
1539 nt
6.28
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
BSC5
YNR069C
1470 nt
6.28
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
RIO1
YOR119C
1455 nt
6.28
□□□□□ -1.4
PEF1
P53238
ATF1
YOR377W
1578 nt
6.27
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
PHO3
YBR092C
1404 nt
6.27
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
PUP2
YGR253C
783 nt
6.27
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
CPR2
YHR057C
618 nt
6.27
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
YJR142W
YJR142W
1029 nt
6.27
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
YNL228W
YNL228W
777 nt
6.27
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
HXT15
YDL245C
1704 nt
6.27
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
HXT16
YJR158W
1704 nt
6.27
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
YNL295W
YNL295W
1575 nt
6.27
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
MUM3
YOR298W
1440 nt
6.26
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
MKK1
YOR231W
1527 nt
6.26
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
RRP43
YCR035C
1185 nt
6.26
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
DOC1
YGL240W
753 nt
6.26
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
MAD2
YJL030W
591 nt
6.26
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
COS10
YNR075W
1125 nt
6.26
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
YNL247W
YNL247W
2304 nt
6.26
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
PMT3
YOR321W
2262 nt
6.25
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
YLL066C
YLL066C
3618 nt
6.25
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
NMA2
YGR010W
1188 nt
6.25
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
PIH1
YHR034C
1035 nt
6.25
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
GCV3
YAL044C
513 nt
6.25
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
PRY2
YKR013W
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6.25
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PEF1
P53238
YLR112W
YLR112W
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6.25
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
ODC2
YOR222W
924 nt
6.25
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
ARP3
YJR065C
1350 nt
6.25
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
CYB2
YML054C
1776 nt
6.25
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
RSC2
YLR357W
2670 nt
6.25
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
ISC1
YER019W
1434 nt
6.25
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
NUP84
YDL116W
2181 nt
6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
YPL245W
YPL245W
1365 nt
6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
PSA1
YDL055C
1086 nt
6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
SNF11
YDR073W
510 nt
6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
YDR215C
YDR215C
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6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
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YDR327W
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6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
YEA6
YEL006W
1008 nt
6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
STS1
YIR011C
960 nt
6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
YIR043C
YIR043C
693 nt
6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
SKG1
YKR100C
1068 nt
6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
ERV25
YML012W
636 nt
6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
ATP23
YNR020C
813 nt
6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
PTR2
YKR093W
1806 nt
6.24
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
VPS72
YDR485C
2388 nt
6.23
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
YBR241C
YBR241C
1467 nt
6.23
□□□□□ -1.41
PEF1
P53238
SPO12
YHR152W
522 nt
6.23
□□□□□ -1.41
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