Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HNMTP50135 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HNMTP50135 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HNMTP50135 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HNMTP50135 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HNMTP50135 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HNMTP50135 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HNMTP50135 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HNMTP50135 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HNMTP50135 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HNMTP50135 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HNMTP50135 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HNMTP50135 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HNMTP50135 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HNMTP50135 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HNMTP50135 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HNMTP50135 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HNMTP50135 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HNMTP50135 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HNMTP50135 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HNMTP50135 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HNMTP50135 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HNMTP50135 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNMTP50135 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNMTP50135 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNMTP50135 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNMTP50135 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNMTP50135 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNMTP50135 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNMTP50135 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNMTP50135 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNMTP50135 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNMTP50135 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNMTP50135 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HNMTP50135 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNMTP50135 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNMTP50135 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HNMTP50135 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HNMTP50135 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HNMTP50135 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HNMTP50135 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HNMTP50135 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HNMTP50135 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HNMTP50135 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HNMTP50135 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HNMTP50135 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HNMTP50135 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HNMTP50135 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HNMTP50135 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HNMTP50135 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HNMTP50135 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HNMTP50135 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HNMTP50135 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HNMTP50135 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HNMTP50135 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNMTP50135 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNMTP50135 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNMTP50135 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNMTP50135 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNMTP50135 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNMTP50135 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNMTP50135 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNMTP50135 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNMTP50135 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNMTP50135 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNMTP50135 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNMTP50135 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNMTP50135 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNMTP50135 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNMTP50135 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNMTP50135 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNMTP50135 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNMTP50135 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNMTP50135 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNMTP50135 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNMTP50135 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNMTP50135 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNMTP50135 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNMTP50135 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNMTP50135 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNMTP50135 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNMTP50135 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNMTP50135 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNMTP50135 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNMTP50135 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNMTP50135 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNMTP50135 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNMTP50135 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNMTP50135 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNMTP50135 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HNMTP50135 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNMTP50135 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNMTP50135 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNMTP50135 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNMTP50135 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNMTP50135 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNMTP50135 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNMTP50135 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNMTP50135 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNMTP50135 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms