Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSSP48449 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSSP48449 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSSP48449 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSSP48449 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSSP48449 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSSP48449 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSSP48449 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LSSP48449 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LSSP48449 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSSP48449 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSSP48449 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSSP48449 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSSP48449 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSSP48449 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSSP48449 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSSP48449 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSSP48449 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSSP48449 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LSSP48449 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSSP48449 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSSP48449 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSSP48449 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSSP48449 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSSP48449 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSSP48449 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSSP48449 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSSP48449 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSSP48449 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSSP48449 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSSP48449 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSSP48449 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSSP48449 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSSP48449 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSSP48449 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSSP48449 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSSP48449 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSSP48449 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSSP48449 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSSP48449 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LSSP48449 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LSSP48449 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LSSP48449 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSSP48449 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSSP48449 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSSP48449 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LSSP48449 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSSP48449 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSSP48449 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSSP48449 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSSP48449 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSSP48449 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LSSP48449 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LSSP48449 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSSP48449 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSSP48449 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSSP48449 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSSP48449 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LSSP48449 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSSP48449 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSSP48449 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSSP48449 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSSP48449 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSSP48449 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSSP48449 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSSP48449 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSSP48449 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSSP48449 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSSP48449 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LSSP48449 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LSSP48449 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LSSP48449 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSSP48449 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSSP48449 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSSP48449 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSSP48449 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSSP48449 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSSP48449 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSSP48449 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSSP48449 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSSP48449 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSSP48449 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LSSP48449 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LSSP48449 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSSP48449 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSSP48449 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSSP48449 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSSP48449 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LSSP48449 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSSP48449 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSSP48449 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSSP48449 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSSP48449 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSSP48449 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSSP48449 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSSP48449 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSSP48449 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSSP48449 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSSP48449 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSSP48449 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms