Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKI67P46013 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKI67P46013 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKI67P46013 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MKI67P46013 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKI67P46013 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKI67P46013 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKI67P46013 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MKI67P46013 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKI67P46013 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKI67P46013 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKI67P46013 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKI67P46013 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKI67P46013 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKI67P46013 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MKI67P46013 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKI67P46013 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKI67P46013 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKI67P46013 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKI67P46013 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKI67P46013 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKI67P46013 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKI67P46013 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKI67P46013 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MKI67P46013 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MKI67P46013 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKI67P46013 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKI67P46013 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKI67P46013 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MKI67P46013 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKI67P46013 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKI67P46013 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKI67P46013 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MKI67P46013 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKI67P46013 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKI67P46013 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKI67P46013 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKI67P46013 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKI67P46013 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKI67P46013 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKI67P46013 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKI67P46013 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKI67P46013 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKI67P46013 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MKI67P46013 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKI67P46013 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKI67P46013 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MKI67P46013 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MKI67P46013 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKI67P46013 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKI67P46013 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MKI67P46013 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKI67P46013 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKI67P46013 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKI67P46013 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKI67P46013 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MKI67P46013 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKI67P46013 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKI67P46013 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKI67P46013 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKI67P46013 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKI67P46013 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKI67P46013 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKI67P46013 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKI67P46013 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKI67P46013 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKI67P46013 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKI67P46013 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKI67P46013 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKI67P46013 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKI67P46013 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKI67P46013 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKI67P46013 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MKI67P46013 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKI67P46013 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKI67P46013 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKI67P46013 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKI67P46013 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKI67P46013 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKI67P46013 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKI67P46013 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKI67P46013 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MKI67P46013 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKI67P46013 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKI67P46013 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKI67P46013 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKI67P46013 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKI67P46013 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKI67P46013 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKI67P46013 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKI67P46013 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MKI67P46013 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MKI67P46013 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKI67P46013 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKI67P46013 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKI67P46013 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKI67P46013 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKI67P46013 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKI67P46013 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKI67P46013 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms