Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPGP40121 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPGP40121 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPGP40121 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPGP40121 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPGP40121 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPGP40121 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPGP40121 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPGP40121 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPGP40121 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPGP40121 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPGP40121 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPGP40121 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPGP40121 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPGP40121 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPGP40121 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPGP40121 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPGP40121 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPGP40121 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPGP40121 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPGP40121 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPGP40121 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPGP40121 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPGP40121 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPGP40121 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPGP40121 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPGP40121 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPGP40121 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPGP40121 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPGP40121 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPGP40121 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPGP40121 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPGP40121 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPGP40121 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPGP40121 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPGP40121 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPGP40121 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPGP40121 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPGP40121 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPGP40121 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPGP40121 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPGP40121 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPGP40121 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPGP40121 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPGP40121 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPGP40121 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPGP40121 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPGP40121 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPGP40121 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPGP40121 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPGP40121 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPGP40121 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPGP40121 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPGP40121 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPGP40121 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPGP40121 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPGP40121 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPGP40121 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPGP40121 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPGP40121 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPGP40121 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPGP40121 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPGP40121 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPGP40121 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPGP40121 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPGP40121 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPGP40121 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPGP40121 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPGP40121 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPGP40121 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPGP40121 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPGP40121 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPGP40121 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPGP40121 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPGP40121 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPGP40121 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPGP40121 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPGP40121 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPGP40121 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPGP40121 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPGP40121 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPGP40121 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPGP40121 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPGP40121 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPGP40121 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPGP40121 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPGP40121 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPGP40121 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPGP40121 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPGP40121 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPGP40121 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPGP40121 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPGP40121 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPGP40121 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPGP40121 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPGP40121 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPGP40121 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPGP40121 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPGP40121 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPGP40121 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms