Protein–RNA interactions for Protein: P36172

VBA5, Vacuolar basic amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA5P36172 RPN5YDL147W 1338 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA5P36172 BRN1YBL097W 2265 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA5P36172 CHS5YLR330W 2016 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA5P36172 MSS116YDR194C 1995 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA5P36172 GTS1YGL181W 1191 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA5P36172 MRI1YPR118W 1236 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA5P36172 BSC5YNR069C 1470 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA5P36172 CDC23YHR166C 1881 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA5P36172 YPL245WYPL245W 1365 nt7.33□□□□□ -1.24
VBA5P36172 YJL163CYJL163C 1668 nt7.33□□□□□ -1.24
VBA5P36172 PTC7YHR076W 1032 nt7.33□□□□□ -1.24
VBA5P36172 SPC24YMR117C 642 nt7.33□□□□□ -1.24
VBA5P36172 YOL046CYOL046C 675 nt7.33□□□□□ -1.24
VBA5P36172 YOR111WYOR111W 699 nt7.33□□□□□ -1.24
VBA5P36172 ECM2YBR065C 1095 nt7.33□□□□□ -1.24
VBA5P36172 PET112YBL080C 1626 nt7.32□□□□□ -1.24
VBA5P36172 YNR005CYNR005C 405 nt7.32□□□□□ -1.24
VBA5P36172 APE4YHR113W 1473 nt7.31□□□□□ -1.24
VBA5P36172 YIR043CYIR043C 693 nt7.31□□□□□ -1.24
VBA5P36172 RFA2YNL312W 822 nt7.31□□□□□ -1.24
VBA5P36172 STF1YDL130W-A 261 nt7.29□□□□□ -1.24
VBA5P36172 SPO12YHR152W 522 nt7.29□□□□□ -1.24
VBA5P36172 FIT2YOR382W 462 nt7.29□□□□□ -1.24
VBA5P36172 ELC1YPL046C 300 nt7.29□□□□□ -1.24
VBA5P36172 SPS22YCL048W 1392 nt7.29□□□□□ -1.24
VBA5P36172 FLC2YAL053W 2352 nt7.28□□□□□ -1.24
VBA5P36172 YKR075CYKR075C 924 nt7.28□□□□□ -1.24
VBA5P36172 IRC11YOR013W 471 nt7.28□□□□□ -1.24
VBA5P36172 TIP41YPR040W 1071 nt7.28□□□□□ -1.24
VBA5P36172 YPR076WYPR076W 375 nt7.28□□□□□ -1.24
VBA5P36172 FES1YBR101C 873 nt7.28□□□□□ -1.24
VBA5P36172 LAG2YOL025W 1983 nt7.28□□□□□ -1.24
VBA5P36172 CYS4YGR155W 1524 nt7.27□□□□□ -1.25
VBA5P36172 ECM10YEL030W 1935 nt7.27□□□□□ -1.25
VBA5P36172 NTG2YOL043C 1143 nt7.27□□□□□ -1.25
VBA5P36172 YOL099CYOL099C 492 nt7.27□□□□□ -1.25
VBA5P36172 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.27□□□□□ -1.25
VBA5P36172 GUS1YGL245W 2127 nt7.27□□□□□ -1.25
VBA5P36172 MAM3YOL060C 2121 nt7.27□□□□□ -1.25
VBA5P36172 EXG2YDR261C 1689 nt7.26□□□□□ -1.25
VBA5P36172 YGL235WYGL235W 537 nt7.26□□□□□ -1.25
VBA5P36172 MSA2YKR077W 1092 nt7.26□□□□□ -1.25
VBA5P36172 GFD1YMR255W 567 nt7.26□□□□□ -1.25
VBA5P36172 PHO85YPL031C 918 nt7.26□□□□□ -1.25
VBA5P36172 CLD1YGR110W 1338 nt7.26□□□□□ -1.25
VBA5P36172 COX15YER141W 1461 nt7.25□□□□□ -1.25
VBA5P36172 BPL1YDL141W 2073 nt7.25□□□□□ -1.25
VBA5P36172 AGX1YFL030W 1158 nt7.25□□□□□ -1.25
VBA5P36172 YAL045CYAL045C 309 nt7.25□□□□□ -1.25
VBA5P36172 SUN4YNL066W 1263 nt7.25□□□□□ -1.25
VBA5P36172 ATP4YPL078C 735 nt7.25□□□□□ -1.25
VBA5P36172 MHP1YJL042W 4197 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA5P36172 RKM4YDR257C 1485 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA5P36172 CAN1YEL063C 1773 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA5P36172 CTA1YDR256C 1548 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA5P36172 THR1YHR025W 1074 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA5P36172 REX3YLR107W 1215 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA5P36172 YNL190WYNL190W 615 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA5P36172 SAS4YDR181C 1446 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA5P36172 PRC1YMR297W 1599 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA5P36172 FCY2YER056C 1602 nt7.23□□□□□ -1.25
VBA5P36172 PPH21YDL134C 1110 nt7.23□□□□□ -1.25
VBA5P36172 HPT1YDR399W 666 nt7.23□□□□□ -1.25
VBA5P36172 GTO1YGR154C 1071 nt7.23□□□□□ -1.25
VBA5P36172 HOC1YJR075W 1191 nt7.23□□□□□ -1.25
VBA5P36172 GCV3YAL044C 513 nt7.23□□□□□ -1.25
VBA5P36172 RGT2YDL138W 2292 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA5P36172 SSC1YJR045C 1965 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA5P36172 BEM1YBR200W 1656 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA5P36172 YLL058WYLL058W 1728 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA5P36172 FCY22YER060W-A 1593 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA5P36172 RTN1YDR233C 888 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA5P36172 LIA1YJR070C 978 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA5P36172 SPE4YLR146C 903 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA5P36172 TIF34YMR146C 1044 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA5P36172 ARR1YPR199C 885 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA5P36172 MET30YIL046W 1923 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA5P36172 LAS17YOR181W 1902 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA5P36172 HER2YMR293C 1395 nt7.21□□□□□ -1.25
VBA5P36172 CMR1YDL156W 1569 nt7.21□□□□□ -1.25
VBA5P36172 RMD8YFR048W 1989 nt7.21□□□□□ -1.26
VBA5P36172 MED2YDL005C 1296 nt7.21□□□□□ -1.26
VBA5P36172 YEA6YEL006W 1008 nt7.21□□□□□ -1.26
VBA5P36172 YIP4YGL198W 708 nt7.21□□□□□ -1.26
VBA5P36172 DAL7YIR031C 1665 nt7.21□□□□□ -1.26
VBA5P36172 YKR018CYKR018C 2178 nt7.2□□□□□ -1.26
VBA5P36172 EDC1YGL222C 528 nt7.2□□□□□ -1.26
VBA5P36172 AIM2YAL049C 741 nt7.2□□□□□ -1.26
VBA5P36172 AIM34YMR003W 597 nt7.2□□□□□ -1.26
VBA5P36172 HAL1YPR005C 885 nt7.2□□□□□ -1.26
VBA5P36172 ASR1YPR093C 867 nt7.2□□□□□ -1.26
VBA5P36172 YPR127WYPR127W 1038 nt7.2□□□□□ -1.26
VBA5P36172 ATG18YFR021W 1503 nt7.2□□□□□ -1.26
VBA5P36172 ARH1YDR376W 1482 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA5P36172 RCK1YGL158W 1539 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA5P36172 SPC42YKL042W 1092 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA5P36172 YNL228WYNL228W 777 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA5P36172 FMP40YPL222W 2067 nt7.18□□□□□ -1.26
VBA5P36172 ENB1YOL158C 1821 nt7.18□□□□□ -1.26
VBA5P36172 snR57snR57 88 nt7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 95.5 ms