Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNB1P35222 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNB1P35222 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNB1P35222 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms