Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGER1P34995 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER1P34995 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER1P34995 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms