Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR1P32246 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR1P32246 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR1P32246 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCR1P32246 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCR1P32246 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCR1P32246 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCR1P32246 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCR1P32246 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCR1P32246 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCR1P32246 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCR1P32246 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCR1P32246 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCR1P32246 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCR1P32246 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCR1P32246 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCR1P32246 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCR1P32246 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCR1P32246 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCR1P32246 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCR1P32246 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCR1P32246 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCR1P32246 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCR1P32246 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCR1P32246 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCR1P32246 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCR1P32246 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCR1P32246 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCR1P32246 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCR1P32246 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCR1P32246 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCR1P32246 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCR1P32246 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCR1P32246 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCR1P32246 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCR1P32246 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCR1P32246 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCR1P32246 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCR1P32246 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCR1P32246 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCR1P32246 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCR1P32246 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCR1P32246 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCR1P32246 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCR1P32246 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR1P32246 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR1P32246 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR1P32246 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR1P32246 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR1P32246 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR1P32246 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR1P32246 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR1P32246 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR1P32246 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR1P32246 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCR1P32246 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCR1P32246 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCR1P32246 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCR1P32246 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCR1P32246 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCR1P32246 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCR1P32246 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCR1P32246 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCR1P32246 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCR1P32246 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCR1P32246 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCR1P32246 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCR1P32246 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCR1P32246 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCR1P32246 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR1P32246 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR1P32246 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR1P32246 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR1P32246 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR1P32246 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR1P32246 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR1P32246 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR1P32246 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR1P32246 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR1P32246 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR1P32246 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR1P32246 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR1P32246 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR1P32246 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR1P32246 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR1P32246 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR1P32246 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR1P32246 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms