Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX1P32242 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTX1P32242 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX1P32242 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX1P32242 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX1P32242 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX1P32242 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX1P32242 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX1P32242 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX1P32242 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTX1P32242 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX1P32242 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX1P32242 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX1P32242 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX1P32242 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX1P32242 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX1P32242 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX1P32242 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX1P32242 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTX1P32242 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX1P32242 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX1P32242 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX1P32242 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX1P32242 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTX1P32242 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTX1P32242 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTX1P32242 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTX1P32242 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTX1P32242 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
OTX1P32242 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTX1P32242 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
OTX1P32242 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTX1P32242 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTX1P32242 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTX1P32242 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTX1P32242 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTX1P32242 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTX1P32242 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTX1P32242 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTX1P32242 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTX1P32242 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTX1P32242 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTX1P32242 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTX1P32242 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
OTX1P32242 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OTX1P32242 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTX1P32242 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTX1P32242 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTX1P32242 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX1P32242 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX1P32242 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTX1P32242 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX1P32242 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX1P32242 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTX1P32242 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTX1P32242 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
OTX1P32242 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX1P32242 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX1P32242 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTX1P32242 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTX1P32242 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTX1P32242 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX1P32242 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX1P32242 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX1P32242 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX1P32242 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX1P32242 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX1P32242 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX1P32242 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX1P32242 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX1P32242 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX1P32242 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX1P32242 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX1P32242 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX1P32242 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX1P32242 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX1P32242 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX1P32242 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX1P32242 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX1P32242 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX1P32242 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX1P32242 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX1P32242 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX1P32242 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX1P32242 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX1P32242 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX1P32242 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX1P32242 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX1P32242 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX1P32242 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX1P32242 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX1P32242 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX1P32242 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX1P32242 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX1P32242 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX1P32242 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX1P32242 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX1P32242 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX1P32242 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX1P32242 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms