Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOBEC3AP31941 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3AP31941 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3AP31941 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms