Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA6P31267 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXA6P31267 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA6P31267 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA6P31267 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.8 ms